წმინდა მატათა მოციქულის სახელობის გიმნაზიაში ფუნქციონირებს სამედიცინო კაბინეტი და იზოლატორი. 

დაწესებულებას ემსახურება სამი პედიატრი: ქეთევან ჯაყელი, თამარ მხატვარი და ნატალია ქობალავა.

ასევე დაწესებულებაში 24 საათიან რეჟიმში მორიგეობით მუშაობს ორი ექთანი: ირმა ბერიძე და ლელა დუმბაძე.

სამედიცინო ოთახი აღჭურვილია ყველა საჭირო მედიკამენტით და ინვენტარით.

ეს დატვირთვა გიმნაზიას გააჩნია იმიტომ, რომ დაწესებულება საჭიროების შემთხვევაში მოსწავლეებს  სთავაზობს პანსიონურ მომსახურებასაც.